Nguyên nhân tự nhiên tác động đến môi trường nước:
Bất cứ một hiện tượng nào làm giảm chất lượng nước đều bị coi là nguyên nhân gây ô nhiễm nước. Ô nhiễm nước do mưa, tuyết tan, lũ lụt… hoặc do các sản phẩm hoạt động sống của sinh vật chưa kể xác chết của chúng. Cây cối, sinh vật chết đi, chúng bị vi sinh vật phân hủy thành chất hữu cơ. Một phần sẽ ngấm vào lòng đất, sau đó sẽ ngấm sâu vào nguồn nước ngầm, gây ô nhiễm, hoặc theo dòng nước ngầm hòa vào dòng lớn.
Lũ lụt có thể mang theo những dòng nước bùn, phèn, khuấy động dòng nước bẩn, mang theo các chất độc hại với cơ thể và môi trường xung quanh.
Sự suy giảm chất lượng nước có thể do đặc tính địa chất của nguồn nước ví dụ như nước trên đất phèn thường chứa nhiều sắt, nhôm, nước lấy từ lòng đất thường chứa nhiều canxi…
Chúng ta cần có các biện pháp phòng tránh, bảo vệ nguồn nước sao cho an toàn, thích hợp đối với người sử dụng và môi trường!!!